Нынешняя Евратория является одним из самых древних городов мира. На сегодняшний момент в Евпатории действует пешеходный маршрут под названием Малый Иерусалим, который позволяет увидеть культовые сооружения шести концессий, а также турецкие бани и ремесленные мастерские изготавливающие различные поделки. Этот маршрут входит в число рекомендованных ЮНЕСКО для посещения в Украине, и все желающие совершить его могут снять жилье в Евпатории.
За свою историю поселение имело три наименования — Керкинитида, Гезлев и Евпатория. В VI веке до н.э. греки основали город-государство Керкинитида, которое в IV в. до н.э. вошло в состав Херсонесса. Этот город имел укреплённую 12 башнями 8-метровую крепостную стену. Керкинитида благоденствовала 7 веков, но жители оставили город перед угрозой нападения сарматских племен.
Археологические раскопки городищ располагаются на территории санатория украинского Министерства Обороны. Под прозрачным куполом в районе улицы Дувановской есть остатки крепостной стены и башен. Наиболее древние поселения Украины находятся именно в Евпатории — это городища Маяк и Чайка относящиеся к Х в. до н.э. В турецкий период город принадлежал крымскому хану и назывался Гезлев, в те времена это была неприступная крепость с 24-мя башнями, здесь базировался турецкий гарнизон.
После русско-турецкой войны Крым присоединили к Российской империи, а Гезлев назвали Евпаторией, в честь царя Понта не единожды выручавшего Керкинитиду при нашествии скифов, его звали Митридат VI Евпатор.
Первая телефонная линия междугородней связи была проведена в 1907 г. между Симферополем и Евпаторией. Популярность города среди отдыхающих росла, поэтому в 1914 г. здесь появился трамвай, а в 1915 г. в Евпаторию стали ходить пассажирские поезда.
В советские времена в 1914 г. Евпатория была признана курортом общегосударственного значения. Совнаром СССР в 1936 г. постановил организовать в этом городе образцовый детский курорт. В 1997 г. Президент Украины присвоил Евпатории статус Всеукраинской детской здравницы.
Празднование 2500-летнего юбилея Евпатории прошло в 2003 г. В старой части города и по сей день сохраняется средневековая планировка, архитектурная часть которой не находит аналогов ни в одном древнем поселении полуострова Крым.